Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Prrt1O35449 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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