Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcns1O35173 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms