Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MsmbO08540 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms