Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms