Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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