Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfpl4bJ3QPR6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfpl4bJ3QPR6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms