Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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