Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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