Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms