Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms