Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms