Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo5cE9Q1F5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo5cE9Q1F5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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