Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad2bE9Q166 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad2bE9Q166 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms