Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms