Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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