Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms