Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6685D3YYP3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms