Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SafbD3YXK2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SafbD3YXK2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SafbD3YXK2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SafbD3YXK2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SafbD3YXK2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms