Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NuggcD3YWJ0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms