Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrnnD3YUU6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms