Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cttnbp2B9EJA2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cttnbp2B9EJA2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms