Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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