Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms