Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zbed5B2RPU8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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