Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Grik3B1AS29 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Grik3B1AS29 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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