Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms