Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms