Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Prdm16A2A935 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm16A2A935 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms