Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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