Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm3550W4VSN7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms