Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm17087V9GXQ2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17087V9GXQ2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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