Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms