Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn8Q9Z260 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms