Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip6Q9Z1Y4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip6Q9Z1Y4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms