Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms