Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms