Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stub1Q9WUD1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms