Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sema6cQ9WTM3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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