Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trpc2Q9R244 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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