Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms