Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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