Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2657.6 ms