Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Qtrt1Q9JMA2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Qtrt1Q9JMA2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms