Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms