Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tgm1Q9JLF6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tgm1Q9JLF6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tgm1Q9JLF6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms