Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Chrac1Q9JKP8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Chrac1Q9JKP8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Chrac1Q9JKP8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Chrac1Q9JKP8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Chrac1Q9JKP8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms