Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc12a4Q9JIS8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms