Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pgpep1Q9ESW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms