Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms