Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3bQ9ES34 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms